Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rims4P60191 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rims4P60191 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rims4P60191 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms