Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sf3b6P59708 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms