Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrn4P59383 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms