Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nphp4P59240 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nphp4P59240 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms