Protein–RNA interactions for Protein: P59108

Cpne2, Copine-2, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne2P59108 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cpne2P59108 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne2P59108 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne2P59108 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne2P59108 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne2P59108 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne2P59108 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne2P59108 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne2P59108 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms