Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Setd4P58467 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Setd4P58467 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Setd4P58467 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms