Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sssca1P56873 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sssca1P56873 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms