Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace1P56818 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bace1P56818 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bace1P56818 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bace1P56818 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bace1P56818 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Bace1P56818 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms