Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctbp2P56546 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctbp2P56546 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms