Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aqp4P55088 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aqp4P55088 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms