Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Faf1P54731 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Faf1P54731 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Faf1P54731 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Faf1P54731 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms