Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab2aP53994 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms