Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apobec1P51908 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Apobec1P51908 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Apobec1P51908 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms