Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hoxc13P50207 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxc13P50207 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms