Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CitP49025 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CitP49025 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CitP49025 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CitP49025 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CitP49025 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CitP49025 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CitP49025 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CitP49025 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CitP49025 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CitP49025 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CitP49025 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CitP49025 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms