Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcd1P48410 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Abcd1P48410 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms