Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pax7P47239 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pax7P47239 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms