Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic1P46684 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zic1P46684 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zic1P46684 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms