Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab11bP46638 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab11bP46638 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms