Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsfP46460 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsfP46460 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsfP46460 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NsfP46460 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NsfP46460 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NsfP46460 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NsfP46460 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NsfP46460 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NsfP46460 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NsfP46460 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms