Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Nkx1-2P42580 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx1-2P42580 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms