Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sept1P42209 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sept1P42209 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms