Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ThpoP40226 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ThpoP40226 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms