Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf1P39428 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf1P39428 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Traf1P39428 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf1P39428 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms