Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grik2P39087 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik2P39087 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms