Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col18a1P39061 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col18a1P39061 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col18a1P39061 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms