Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ercc5P35689 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ercc5P35689 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms