Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PpardP35396 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PpardP35396 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PpardP35396 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PpardP35396 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpardP35396 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpardP35396 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpardP35396 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PpardP35396 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PpardP35396 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PpardP35396 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PpardP35396 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PpardP35396 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PpardP35396 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms