Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rab3dP35276 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms