Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ifnar1P33896 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ifnar1P33896 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ifnar1P33896 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms