Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SsbP32067 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SsbP32067 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SsbP32067 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SsbP32067 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SsbP32067 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SsbP32067 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SsbP32067 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SsbP32067 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SsbP32067 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SsbP32067 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SsbP32067 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SsbP32067 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms