Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc5P32043 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxc5P32043 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms