Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VtnP29788 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VtnP29788 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VtnP29788 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VtnP29788 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VtnP29788 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VtnP29788 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VtnP29788 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VtnP29788 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VtnP29788 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms