Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Mmp3P28862 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp3P28862 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms