Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc6a9P28571 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms