Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjb1P28230 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb1P28230 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb1P28230 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjb1P28230 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjb1P28230 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gjb1P28230 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms