Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ctnna1P26231 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ctnna1P26231 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms