Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gabra3P26049 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabra3P26049 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms