Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NdnP25233 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NdnP25233 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NdnP25233 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NdnP25233 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NdnP25233 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NdnP25233 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NdnP25233 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NdnP25233 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NdnP25233 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms