Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm2P23804 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm2P23804 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm2P23804 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm2P23804 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm2P23804 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mdm2P23804 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mdm2P23804 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mdm2P23804 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms