Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PrkcaP20444 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PrkcaP20444 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms