Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox5bP19536 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox5bP19536 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cox5bP19536 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox5bP19536 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox5bP19536 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox5bP19536 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms