Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RargP18911 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RargP18911 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RargP18911 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RargP18911 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RargP18911 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RargP18911 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RargP18911 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RargP18911 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RargP18911 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RargP18911 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RargP18911 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RargP18911 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms