Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P18532 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18532 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18532 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18532 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18532 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18532 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18532 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms