Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptbp1P17225 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptbp1P17225 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms