Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calb1P12658 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Calb1P12658 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb1P12658 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calb1P12658 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms