Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxb4P10284 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxb4P10284 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms