Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifna9P09235 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ifna9P09235 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms