Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LtaP09225 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtaP09225 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtaP09225 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtaP09225 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LtaP09225 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LtaP09225 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LtaP09225 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LtaP09225 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LtaP09225 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LtaP09225 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LtaP09225 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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