Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Me1P06801 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Me1P06801 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Me1P06801 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Me1P06801 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Me1P06801 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Me1P06801 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Me1P06801 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Me1P06801 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Me1P06801 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Me1P06801 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Me1P06801 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Me1P06801 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms